图1. MEGA软件的下载界面

1.2 免费试用版（Free trial）

获取网址为，www..com/t---.aspx，请点击该链接进行下载。

图2.

二、软件安装完成

软件依照指导进行部署，过程十分便捷dnastar lasergene，大致仅需按提示操作几次即可，安装完毕后的界面效果如附图3所示。

图3, 上半部分展示的是MEGA v6.06安装成功后的界面, 下半部分则是.v7.1安装成功后的文件清单

三、PEDV数据的准备和打开

需要备齐PEDV参考毒株，这些毒株应当涵盖经典PEDV毒株，经典PEDV毒株所衍生的疫苗毒株，中国大陆地区具有代表性的新型PEDV毒株，韩国的新型PEDV毒株，以及美国的新型PEDV毒株。针对国内广泛传播的PEDV病毒株，能够借助PEDV S基因实施识别和确诊，笔者先前亦曾指出（Chen et al., 2016），可运用S基因序列的N端部分进行识别和确诊，表1展示了实验室刘洋学生公布的测定PEDV S基因N端所使用的引物序列。

表1. PEDV S1基因测序引物（刘洋等，2016）

把所有毒株全部导入到子软件的版本号是.v7.1的那个里面去，接着点选全部作为一个选项，这样就能获得所有数据的汇总了。

图4. 打开所有数据，并保存为集合

四、PEDV分子进化树的建立

使用MEGA 6.06软件打开数据集文件，接着选择图5中的Align by功能，执行序列对齐操作。对齐工作结束后，需要移除不必要的序列，同时更改病毒株的标识名称。

图5. PEDV毒株的比对

打开数据菜单，接着挑选 ，随后选取列表首位旁边的dnastar lasergene，具体配置方式参照下图。

构建出相应的演化图谱，将个人采集的资料加以标注，随后选择图像选项进行存储。这一环节达成了PEDV病毒株分子演化图谱的解析任务。

五、PEDV毒株同源性分析（使用软件）

挑选合适的程序，点一下文件，再敲一下回车键，开始输入数据，等数据全部载入后，到视图部分进行挑选，接着把成果另存为文件，或者直接进行屏幕截图，这样就能得到我们想要的信息。

六、总结

本文阐述了PEDV测序完成后的分子系统发育树及同源检测，倘若存在不明之处或存有疑问，敬请于微信平台下方发表留言，谨致谢忱。

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