开发方向存在诸多，其中包含机器学习，还有数据挖掘，以及网络开发，甚至爬虫等等。实际上于生信领域，并不会展现出绝对的优势，生信的多数软件流程系由shell编写而成，或者是用Perl编写的，并且已然足够好用。我作出选择是由于我想要顺便学习一些数据挖掘方面的内容，还有机器学习方面的东西，而且这些年其愈发火爆，发展态势远远超过其他脚本语言，所以学习它必然是没有错误的。

一、入门标准

入门比较难定义，什么程度才算入门呢？

掌握基本的语法，熟练使用的内置类型、内置函数和数据结构。

了解一些基本的模块的使用，能够实现一些简单的需求。

后面存在一个实例，要是你能够简便地完成，那么无疑我笃定你已然入门了。

二、基本知识点

1.基本语法

缩进，它是依靠代码缩进来对代码层次逻辑予以确定的，通常来讲会约定采用4个空格 。

主要存在版本方面的问题，其中涵盖2.x系列的，还有3.x系列的，这两者在语法上存在差异，并且是不相兼容的，存在部分模块，其只能在指定的版本状况下进行安装 ，建议采用3.x版本，要是遇到特殊的问题，再去运用指定版本解决 。

文件编码声明，会前往环境变量当中找寻解释器，倘若代码里面含有中文，那么就要采用utf-8编码。

#!/usr/bin/env python
#-*- coding: utf-8 –*-

变量定义：使用前要先定义

dir 函数，用于列出一个数据类型或者对象的所有方法，该函数非常好用，与 help 函数具有相同的作用 。

文件相关操作：f 等于打开操作，f 进行关闭操作；借助 with 语句以打开操作执行并将其赋予 f ，操作系统路径相关操作，操作系统路径相关操作，操作系统路径相关操作。

目录操作：使用os.mkdir()进行目录创建，使用os.rmdir()进行目录删除，os还存在其他操作，使用os.chdir()用于改变目录

开发环境选择：

进行数据处理，其中基本数据类型包含，布尔类型，整型类型，浮点型类型，字符串类型。

# 字符串的内置函数，都比较有用
'capitalize', 'casefold', 'center', 'count', 'encode', 'endswith', 'expandtabs', 'find', 'format', 'format_map', 'index', 'isalnum', 'isalpha', 'isdecimal', 'isdigit', 'isidentifier', 'islower', 'isnumeric', 'isprintable', 'isspace', 'istitle', 'isupper', 'join', 'ljust', 'lower', 'lstrip', 'maketrans', 'partition', 'replace', 'rfind', 'rindex', 'rjust', 'rpartition', 'rsplit', 'rstrip', 'split', 'splitlines', 'startswith', 'strip', 'swapcase', 'title', 'translate', 'upper', 'zfill'

2.2 基本数据结构：列表、元组、字典、集合。

数据结构就是一种容器，用于在内存中存放我们的数据。

列表：任意元素组成的顺序序列，以位置为索引。

# 列表的内置函数
'append', 'clear', 'copy', 'count', 'extend', 'index', 'insert', 'pop', 'remove', 'reverse', 'sort'

有一种数据结构叫元组，它类似于那种不可变的列表，具备防止出现错误修改的特性，还能够节省内存方面的开销，这就是元组，而元组解包

# 元组的内置函数
'count', 'index'

字典：键值对，没有顺序，键必须是常量。

# 字典内置函数
'clear', 'copy', 'fromkeys', 'get', 'items', 'keys', 'pop', 'popitem', 'setdefault', 'update', 'values'

集合，它不具备可称作顺序的特性，其所含元素彼此之间不存在重复现象sublime text python，从某种意义上可以理解为，它类似于舍弃了具体值的字典。针对集合，存在着诸如&，|，-，^sublime text python，=等这样的操作

# 集合内置函数
'add', 'clear', 'copy', 'discard', 'pop', 'remove', 'update'
'isdisjoint','issuperset','issubset','symmetric_difference','difference','union', 'intersection', 'symmetric_difference_update','intersection_update','difference_update',

2.3 控制语句

条件：if…else…

循环：for，while，break，

2.4 模块使用

存在着极为友善亲切的模块进行安装的方式，仅凭借一个pip命令，差不多能够安装为数众多的绝大多数模块，提议在使用模块之前，多多去看与之相关的API文档。

最为常用的模块存在着，sys，os，re，csv，gzip，time；于百度之上有着诸多相当不错的模块使用入门教程。

三、入门实例

题目：从诸多FASTA文件里提取特定序列，并且针对所提取的序列施行某些处理（像是求取反向互补序列），句号

描述：假设你存有许多测序数据，这些数据分别存放于不同文件夹内的不同文件当中，此刻给予你一些序列名，要求你从众多的这些数据里提取出特定的序列。

特别说明：此处原本应当存有诸多实例，并且大神亲自录制了好些视频，能够在我们的论坛（网址为http://www..com/forum-90-1.html）寻觅到每个实例的详尽描述，以及代码，还有解题思路 。

遍历每一个文件夹，遍历每一个文件，读取文件，判断序列，输出序列（处理），关闭文件，处理数据，添加一个函数即可 。

四、精通标准

固然这仅是个噱头，熟练掌握的路途是没有尽头的，接下来只是陈列了一些平常的高级特性。

五、最后

只不过是一门编程语言 ，并且是一种实现工具 ，我们能够用好多语言将它替换掉 ，我们之所以做出选择 ，原因在于我们喜爱它给予我们的方便捷迅 。要是你想潜入某个领域 ，实际上真正关键重要的是技术背后的算法 。

六、推荐资源

生信菜鸟专栏属于生信技能树论坛的版主团队，团队成员生信技能背景多样，在文件格式方面有对应人才，在数据资源方面有对应人才，在软件使用方面有对应人才，在脚本技巧方面有对应人才，在统计绘图方面有对应人才，在组学实战方面有对应人才。并且本专栏会从基础入手并深入展开，为毫无基础的各位解析生信技能。

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