发布时间:2023-07-27
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概述
全面的序列分析软件,用于序列比对、桑格测序、虚拟克隆、引物设计、质粒作图、序列编辑等。
每个分子生物学家都需要可靠的序列分析软件来完成日常任务,例如编辑和比对序列以及设计可行的质粒和克隆。 这些任务实际上可能是例行公事dnastar序列比对,但它们的成功会影响下游的其他一切。 这就是为什么拥有可靠、易于使用的工具来每次都能正确完成工作如此重要。
它可以帮助您完成重要的序列分析任务,包括多重序列比对、PCR质粒设计、计算机克隆和序列组装。 现在,您可以利用批量编辑、自动序列注释、访问仔细注释的引物向量图谱目录以及与 NCBI 数据库完全集成等富有洞察力的功能,更快地实现分析目标。 超越基础知识,提供值得您信赖的真正卓越的序列分析软件。
工作过程
手动虚拟克隆
每次使用都让您对实验室克隆实验充满信心!
从本质上讲,分子克隆的过程很简单,但如果没有适当的计划和意图,即使是最简单的克隆实验也可能很快出错。 使用执行虚拟克隆可以让您轻松、自信地计划克隆实验,以获得实验室中的正确结果。 提供无与伦比的灵活性,帮助您满足实验要求,包括同时批量克隆片段组的能力,并指导您使用所有最流行的克隆方法逐步制备载体和扩增插入片段: 、 、 、 、 In- 、TA、TOPO 和 PCR 引导的限制性内切酶克隆。 计算机克隆为您提供正确的计划和计划,以便您每次都可以充满信心地进行克隆实验!
克隆序列验证
用于确认实验室创建的克隆的真实性。
您已经在实验室中创建了克隆,并准备好进行下游实验dnastar序列比对,但您如何知道所有步骤都已产生预期的重组克隆? 许多研究人员已经通过桑格测序验证了其克隆的真实性。 我们可以轻松地进行克隆序列验证,以确认您的桑格测序结果与您设计的克隆完美匹配。 我们的克隆序列验证工作流程确认克隆完全包含正确方向的感兴趣的插入片段,与载体处于框内,并确认整个克隆中跟踪文件的足够覆盖。 如果在克隆序列验证过程中发现差异,我们将向您准确展示差异所在,以便您解决这些问题。 在继续下游实验之前,使用克隆序列验证工作流程捕获读取错位和插入错误。
凝胶电泳模拟
跳过试验和错误,并使用凝胶电泳模拟来确认您的理想条件!
凝胶电泳有时需要大量的规划工作和反复试验才能确定完美的琼脂糖比例和分子量标记集来解析 DNA 片段。 其他时候,限制性消化形成如此复杂的限制模式,以至于很难确定限制性消化是否完成。 这就是我们在 中提供虚拟凝胶电泳的原因,它允许您对一个或多个 DNA 片段应用不同的限制性内切酶并模拟消化以确定电泳凝胶上产物的预期大小。 使用凝胶电泳模拟轻松确定理想的琼脂糖比例和一组分子量标记,以便在实验室进行凝胶电泳之前解析 DNA 片段。 在实验室中运行实际凝胶后,您可以将凝胶或其图像与虚拟凝胶电泳图像并排,以识别具有复杂条带图案的凝胶。 跳过试验和错误,并使用凝胶电泳模拟来确认您的理想条件!
紫蓝色基因组比对
用于轻松执行紫红色基因组比对并比较结构复杂性的多个基因组。
在多序列比对领域,可信的 Mauve 算法与传统算法的区别在于它能够比对全染色体序列和包含结构重排的序列。 多基因组比对通常需要与传统多序列比对器不同的方法,需要您在各种分析工具之间切换。 这就是为什么我们无缝集成了 Mauve 算法,以便您在一个易于使用的应用程序中获得多序列比对所需的一切。 只需将您的基因组拖放到其中,然后使用默认设置执行紫红色基因组比对,或更改参数以满足您的需求。 基因组比对后,即使在不同的缩放级别,也可以轻松导航和查看多个序列的保守区域。 在导入出版质量的可编辑图像之前,根据需要自定义对齐的外观。 在您信任的同一应用程序中轻松执行 Mauve 基因组比对,满足您所有的多序列比对需求。
多序列比对
用于精确的序列比对和深入的分析。
众所周知,有许多多重序列比对工具,但初始序列比对只能让您到目前为止。 真正让您走上回答研究问题的道路是对齐后分析。 提供多序列比对每个阶段所需的一切,包括比对基因级和基因组规模序列数据所需的算法,以及在比对后阶段进行更深入挖掘的功能。
指导您完成比对后过程,包括生成和比较多个系统发育树,以及识别和剖析弧菌中的基因组变异。 您可以轻松隔离新的子比对的感兴趣区域,编辑和修剪单个序列或整个比对,并在生成适合发布的高质量图像之前自定义比对的外观。
序列比对软件功能
成对序列比对
轻松执行多重和成对序列比对。
有时,直接检测多序列比对中的一对序列可能会让您更好地了解该对的相关性。 众所周知,有时配对序列比比较性多重比对更合适,例如,将未表征基因的序列与相关参考弧菌的基因组进行比较。 还使您能够灵活地使用行业标准的史密斯算法执行局部、全局和半全局成对序列比对,所有这些都在您用于多序列比对和比对后分析的同一个应用程序中进行。 这使得通过多重比对进一步探索序列对的相关性、将转录本与基因比对或在基因组中查找基因变得容易。
PCR定点突变
在设计质粒之前了解突变的结构影响。
PCR定点诱变是将突变引入DNA序列的最常用技术之一,但大多数软件工具在设计质粒时并未考虑突变对蛋白质结构的影响。 提供独特的PCR定点诱变质粒设计方法,首先重点预测DNA序列中引入的哪些突变可能会导致蛋白质稳定性的变化。 使用我们的热点扫描和创建变体工具,您可以快速查看哪些突变减少或增加了倍数稳定性。 一旦您确定了实验的最佳候选变体,您就可以创建 PCR 质粒,并使用我们用于设计和突变质粒的点击工具将它们引入您的序列中。 与传统的诱变实验试错方法相比,我们独特的结建模和质粒设计工具组合可以为您节省时间和金钱。
PCR质粒设计
使用专为您的首次 PCR 设计的值得您信赖的质粒。
说实话,没有什么比花费时间和金钱构建多次失败的 PCR 反应更令人沮丧的了。 事实上,影响PCR成功的因素有很多,但一般发生失败时,不良的PCR质粒设计就是罪魁祸首。 通过设计符合您特殊实验条件的 PCR 质粒来解决这个问题,并使您能够在实验室尝试之前听到潜在变化的影响。 它实现了指导性、可编辑性和定制性的完美平衡,让您也能设计出可靠的 PCR 质粒。
系统发育分析
精确彻底的系统发育分析软件
系统发育解剖是分子生物学的一个基本方面,也是我们理解基因、生物体和种群之间进化关系的主要工具。 提供全面、易于使用的界面,用于集成多个序列比对和系统发育分析 - 无需笨重的插件。 使用邻接或最大残差 (RAxML) 分析选项轻松构建系统发育树,生成多个树以进行并排比较,生成引导支持值等。 在作为图像导入进行发布或协作之前,自定义系统发育树的外观。
入门地图创建
使用 ! 获得精致、注释清楚的引物图谱!
无论您是要创建用于出版还是用于克隆实验的引物图谱,注释清晰的引物都是必不可少的。 许多引物设计工具缺乏格式化选项,使用起来很麻烦,导致图谱不可读,并且通常缺乏对实验至关重要的功能和限制位点。 提供了一个高贵的界面,可以轻松创建和注释图形丰富的地图,以进行克隆、协作和出版。 轻松显示和自定义站点和功能,并使用我们广泛的、精选的功能数据库和外部手动工具准确注释您的引物。 还包括一个定制载体目录,为计算机克隆提供了仔细注释的引物载体图谱。 告别笨重的工具,轻松创建和定制精美的底漆地图!
灵活的引物设计软件
桑格序列组装
对装配的准确性充满信心。
组装测序数据是 DNA 测序中最关键的步骤之一,因为准确性非常重要。 我们在序列组装软件中使用的组装算法已被证明是市场上测序数据最准确的。 与竞争对手相比,我们的算法在将序列组装成单个重叠群方面做得最好,并通过迹线质量和形状调用最精确的一致序列。 组装后,您可以轻松编辑组装数据(暴露或修剪末端、引入突变)和分析组装数据,包括查看色谱图、评估覆盖范围和分析变体。 正确地做事很重要。 使用最新的序列组装工具,并对组装的准确性充满信心。
序列编辑和注释
在一款易于使用的应用程序中获得全面的序列编辑和注释!
序列编辑是分子生物学研究的主要部分,尽管任何序列编辑软件都可以做到这一点。 但最终,您选择的工具的便利性和功能性确实很重要。 除了提供序列编辑器所有预期的功能:修饰核酸和肽、翻译、反向互补、添加功能、识别ORF、引入限制性位点外,它还提供手动批量编辑工具,以便您可以无缝地创建和编辑序列。编辑序列组,让您更快地完成序列编辑目标。 实时交互式视图允许您轻松编辑和注释序列、自定义功能以及创建引物图谱。 我们的序列编辑软件还与 NCBI 数据库集成,可以轻松访问和搜索在线数据库。 您使用的工具很重要。 在一个易于使用的应用程序中访问序列编辑和注释所需的一切。
应用
序列编辑、克隆和质粒设计
提供序列分析工具,可轻松进行序列编辑和注释、质粒图谱创建、计算机克隆和 PCR 质粒设计。
多序列比对
快速轻松地执行多个序列比对,然后指导您完成比对后过程,包括彻底的系统发育解剖。
桑格序列组装和解剖
在有或没有参考的情况下精确组装测序数据,并包括一个易于使用的界面,用于预览和修剪跟踪数据。
基因发现和基因注释
提供一套全面的分析方法,可以轻松查找和注释序列上的基因和调控装置。
手动序列编辑实用程序
翻译和格式转换等功能可以与可自定义模板一起使用,从而可以轻松同时编辑大量序列和注释。
基因组插图实用程序
支持生成可定制的出版质量图形,用于线性或方形基因组作图。
比较套餐
最受欢迎
包含的应用程序
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