“通过将最新的同行评审 NGS 算法从命令行引入直观的点击式界面dnastar序列比对，为台式科学家提供支持。无论是执行参考引导比对、从头组装、变异调用还是 SNP 分析，它都可以让您访问结果。” 你需要的工具。 集成了全面的袖扣套件，用于 RNA-Seq 数据的深入转录分析和基因表达差异。 RNA-Seq 数据的独特可视化可以通过自定义绘图和图表轻松生成，因此可以在几秒钟内为您提供可发布的图形。”

下一代 DNA 测序 (NGS)

函数列表

测序

使传统的序列组装看起来很简单，同时让您保持控制。

轻松修剪序列以查找质量较差的数据。 您甚至可以维护一个修剪标准库，让生活变得更轻松。

通过直观的控件，您可以为您的数据选择最佳算法，包括“组合到参考”。 如果您正在使用来自不同来源的多个样本，请使用按名称组装手动组装。

使用可帮助您查找和解决歧义、检查杂合性和连接数据的工具，编辑数据从未如此简单。

使用置信值帮助进行数据修剪、质量检查和SNP检查，以提高结果质量。

新一代测序

, Inc. 旨在为您带来在同行评审期刊上开发和发布的各种比对和组装算法，但非工程师也可以使用。 例如，GSNAP (Tom Wu, Inc.) 被认为是正确识别融合点的最佳算法之一。 生物信息学专家可能会像这样调用该程序：

如果我们有一些工具来帮助我们了解所有可用的标志和参数是什么以及它们如何影响程序，我们大多数人都会更有效率。 该界面可帮助您选择选项、设置值并通过说明和工具提示了解可用功能。 与上述命令行中相同的选项可以通过以下方式设置：

只需几个步骤即可执行 SNP 分析、甲基化分析或 RNAA 与 G 耐受性比对。

在平板电脑笔记本中查看结果。

BWA、Maq、GSNAP 而仅仅是开始。 如果您对混合群体进行测序dnastar序列比对，请将参考引导比对与从头组装的力量结合起来。 将读数与参考对齐并捕获未对齐的读数，以进行下一轮基于参考的对齐或从头组装。

通过添加该试剂盒，您可以使用我们为所有 NGS 算法开发的相同套接字样式执行 RNA-Seq 差异表达。

我们还添加了您期望的图表，例如火山，因此您无需使用命令行即​​可查看结果。 因为我们知道您有喜欢的矫正器，所以我们不会坚持使用我们的。 只要您的对齐器创建 SAM 或 BAM 作为其输出，您就可以使用最受尊敬的 RNA-Seq 工具之一来探测您的数据。

通常被解剖

参考序列是一个强大的功能，用于控制编号、功能等。 将其与残差表结合使用，可以轻松确定您正在查看的是已知的还是未报告的 SNP。

直接使用项目桌面对齐序列。 当您有来自不同来源的多个样本时，您甚至可以使用按名称组装。

根据您的工作生成报告。 残差表中的 PDF 报告是共享信息、将其保存在实验室计算机上或在演示文稿中使用的好方法。

自定义工作区、控制窗口位置并使用标签来区分序列和重叠群。 使用主题和突出显示来识别序列区域。 维护模板中的所有设置，以便您和您的朋友可以使用相同的标准操作程序。

表示对序列或序列组执行多重分析的新方法。 扩展功能允许您设置“通道”，在该“通道”上可以使用不同的参数或数据库运行不同的分析。 通过同时在不同通道上的多个序列或序列组上同时运行分析，可以提高结果率。

现在越来越灵活和可定制。 可以重新打开现有的加入会话并向其中添加新序列。 可以重命名加入会话以反映您的项目。 现在有更多选项可用于将频道添加到加入会话，并且还可以为每个频道命名。

您可以在连接会话中对单个序列执行 BLAST 搜索。 可以设置频道以搜索具有不同参数的NCBI数据库或每个频道使用的数据库。 可以设置本地 BLAST 频道来搜索计算机上的数据库。 您还可以建立一个质粒-BLAST 流程，在感兴趣的区域设计一个质粒，然后将这个质粒序列发送到您的产品中。 质粒序列将具有彩色核苷酸和应用于它们的质粒特征。 示意图在单个窗口中显示来自多个通道的结果，允许您比较不同运行的结果。

您的加入会话与您的项目一起手动保存。 使用新的会话启动器，可以轻松创建新会话、向现有会话添加更多数据，或者简单地查看并重新运行旧会话以查看是否有任何新的感兴趣序列已添加到数据库中以前的查询中。 同时使用示意图提供 BLAST、部分 BLAST 和质粒 BLAST 解剖的图形概述。 同时打开多个会话的能力意味着您可以轻松查看所有结果。 当您的结果最终从 NCBI 的网站上过期时，您可以确定它们仍将安全地加入。

您可以在会话中为一组序列运行比对。 结果可以被视为对齐序列或使用系统图可视化。 可以设置不同的通道使用不同的参数。 序列可以添加到现有会话中，允许不同的行查看不同的序列集。 然后可以比较在不同车道和行上运行的内容。

*天津卡贝信息技术有限公司是软件在中国的授权经销商。 如果您有任何需求，请联系我们。

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