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dnastar引物设计 科研小技巧(5)两个网站,搞定所有sgRNA设计

发布时间:2023-07-02

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只有套路,没有弯路!你好,我是小白

如果想要利用/Cas系统敲除基因,或者激活/抑制基因转录dnastar引物设计,就必须涉及到sgRNA的设计。 明天,两个sgRNA设计网站将处理所有序列的sgRNA设计!

说到这里,就必须要说到张峰大师了。 他自己建立的网站确实更新了很多功能。 然而不知为何,现在感觉繁琐多了dnastar引物设计,网站打不开。

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那你就只能另寻他法了。 因为通常需要的sgRNA要么是已知基因的质粒设计,要么是非编码区的质粒设计。

1.已知基因的质粒设计,推荐使用网站:

1、我们以小鼠Setd2为例,使用Cas9对其进行激活表达。

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2、选择相应选项后,点击,稍等片刻,点击下载结果。

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3. 下载.txt 格式文件。 用 Excel 打开它。 红框内为Cas9系列。 基于载体引物(通常为BbsI)的限制性位点,将序列添加核酸内切酶的粘端,合成质粒,固溶后即可与载体连接。

2.非编码区的质粒设计,推荐使用网站:

1. 将设计质粒的序列复制到框中。 这是一个随机基因组的示例作为演示:

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2. 点击后,等待一段时间,然后选择排名靠前的sgRNA进行质粒合成。

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这两个网站基本可以涵盖所有关于sgRNA的质粒设计,无论你是已知基因还是非编码区,都可以搞定

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