发布时间:2023-07-29
浏览次数:0
对于每个进入生物学领域的人来说,分子克隆基本上是不可避免的。 事实上,需要一款功能强大的DNA比对软件。 明天强烈推荐给大家一款DNA比对软件:
猿类 (一)
这个软件除了DNA序列比对和DNA序列翻译之外,还可以做质粒设计、酶切位点设计、引物图谱制作(这个还是比较有用的,但是他们要收费的)、ORF搜索等等实用的功能,让我详细介绍一下这些常用的功能。
1. DNA序列比对
在对话框中粘贴序列,工具栏有一个反向互补工具,图标是一个单向箭头,在反向排序时可用。 创建另一个文件dnastar序列比对,粘贴所需的序列并进行比较:
在“工具”中选择“”以执行配对序列比对。 结果一目了然,并用黑色清晰标记。 双击想要查看的位置即可进入对话框,可以轻松找到突变的位置。
2. 翻译DNA序列
选择要翻译的序列,ctrl+T即可将DNA序列翻译成蛋白质序列,还可以设计每行的长度和蛋白质缩写的形式。
3. 质粒设计
输入序列,在Tools中找到find,会弹出一个对话框,包括厚度、Tm值、GC浓度、、二级结构等参数dnastar序列比对,可以自己设计。
4. 限制位点设计
在进行分子克隆时,将片段插入引物的常用方法是通过酶消化连接。 这时就需要考虑哪些酶切位点适合目标片段。
同样在输入序列后,点击选择或者快捷键ctrl+E,会弹出常用酶的限制性内切酶列表。 点击酶标记所需的内切酶,双击酶名称,弹出该酶的酶切位点信息。
5.ORF搜索
用键盘点击序列的任意位置,然后向前()搜索ORF序列或者从该位置向前(Find),点击,软件就会给出搜索的结果。
APE Tools中的功能非常多,例如引物图谱创建、sgRNA设计、Gate等强大的设计功能,满足了实验室的大部分常规使用,您可以根据自己的需求进行学习。
这个软件对于刚开始学习分子克隆的人来说真的很友好,快来下载试试吧~
软件下载链接:
如有侵权请联系删除!
Copyright © 2023 江苏优软数字科技有限公司 All Rights Reserved.正版sublime text、Codejock、IntelliJ IDEA、sketch、Mestrenova、DNAstar服务提供商
13262879759
微信二维码