在之前的文章《》中，我介绍了一个好用的在线蛋白质序列展示工具，它可以在展示蛋白质序列的同时展示蛋白质二级结构。 如果它是核苷酸序列或者没有可用的二级结构文件怎么办？ 明天给大家介绍一下如何使用该软件导入序列对比图片。

序列加载和对齐

它可用于核苷酸和蛋白质的多序列比对。 为了方便比较，本文中比对所用的序列与“”相同。

首先，将要对齐的序列加载到不同的通道中。 本文将之前的“lala.aln”文件中的多个序列一次加载到多个通道中。 其技巧如右图所示（其实你也可以将单个序列文件逐个加载到通道中）。 请注意，打开文件的格式应更改为“”，单击“否”将加载蛋白质序列。

接下来，对导出的序列进行多序列比对。 方法如右图所示，所有参数保持默认，点击“下一步”即可。

比较后的最终结果如右图所示：

色彩调整

接下来，自定义每个序列显示的“字母”数量和着色方案。 点击进入调整面板，调整每行序列显示的“字母”数量（右图蓝色线框），并修改字体。 本文保留默认值，每行显示 40 个多肽残基。

接下来，根据序列的相似程度对序列进行着色。 点击“色块”，进入自定义颜色窗口。 这里我选择了类似的更亮更亮的颜色。 事实上，您还可以添加并使用您喜欢的颜色，如右图所示。

图片导入

修改颜色后，即可导入图像。 导入图片有两种方式，见右图，但只能导入emf格式的矢量图形。

关于emf格式，在《》一文中专门做了介绍，emf格式可以直接在Word和PPT中使用。 以下是导入的序列图片在PPT中的显示效果（裁剪后）：

概括

它可用于显示核苷酸和蛋白质序列的比较。 虽然疗效不是很好看，但是通过修改字体和配色也可以输出高质量的序列图。 这里补充一下，《》中也提到dnastar序列比对，（PPT）是用来转换emf图像格式的，PPT中保存的JPG格式图像质量不好。 建议将整个幻影kt板另存为PDF。 （AI）并且可以打开和编辑emf图片dnastar序列比对，就这张图片而言，效果不是很好

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