之前在《》文章中，我给大家介绍了一个好用的在线蛋白质序列展示工具，它可以在展示蛋白质序列的同时，展示蛋白质二级结构。 如果它是核酸序列或没有可用的二级结构文件怎么办？ 今天给大家介绍一下如何使用软件导出序列比对图像。

序列加载和对齐

它可用于进行核酸和蛋白质的多重序列比较。 为了便于比较，本文中用于比较的序列均与“”相同。

首先，将要比较的序列加载到不同通道中。 本文一次将最后一个“lala.aln”文件中的多个序列加载到多个通道中。 方法如下图所示（当然也可以将各个序列文件逐个加载到通道中）。 注意，打开的文件格式应改为“所有文件”，点击“否”将加载蛋白质序列。

接下来，对导入的序列进行多序列比对。 方法如下图所示。 所有参数保持默认dnastar序列比对，然后单击“下一步”。

对比后最终结果如下图所示：

阴影调整

接下来，自定义每行序列显示的“字母”数量和着色方案。 点击进入调整面板，在这里可以调整每行序列中显示的“字母”数量（下图中粉色线框），还可以更改字体。 本文保留默认值，每行显示 40 个氨基酸残基。

下面，根据序列相似性级别为序列着色。 点击“色块”进入自定义颜色窗口。 这里我选择了类似的更亮更亮的颜色。 当然，您也可以添加并使用您喜欢的颜色，如下所示。

图片导出

更改颜色后，就可以导出图像了。 导出图像有两种方式，见下图，但只能导出emf格式的矢量图像。

关于emf格式，在《》一文中专门做了介绍。 emf格式可以直接在Word和PPT中使用。 以下是导出的序列图在PPT中的显示效果（裁剪后）：

概括

它可用于显示核酸和蛋白质序列比较。 虽然显示效果不是很好看，但是通过改变字体和颜色也可以输出高质量的序列图像。 另外，《》中还提到使用（PPT）转换emf图像格式，但是PPT保存的JPG格式图像质量不好，所以建议将整个幻灯片保存为PDF。 （AI）并可以打开和编辑emf图片。 就这张图来说dnastar序列比对，效果不是很好。

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