*K元组的大小一般设置在2-6之间，具体取决于序列的长度和变异性。 通常，较短的 K 元组能够更好地捕获序列中的局部相似性，但可能在比对过程中产生不匹配。 较长的 K 元组可以更好地区分序列差异，但可能会遗漏一些相似区域。

*gap和gap：这两个参数控制，即对gap出现的惩罚程度。 一般来说，gap的值应该高于gap，因为在实际的生物序列中，gap出现的概率较低。 建议初始值分别设置为10和0。

*“delay seqs%”是多序列比对中的参数。 其功能是在比对过程中控制高度分歧的序列的跳过，以减少这些序列比对结果的影响。

完成后dnastar序列比对，等待结果。 在此窗口中，您可以查看序列比对结果，包括比对分数、相似度矩阵、序列同源性等信息。

您可以使用“文件”菜单下的“另存为”选项将比较结果保存为文本文件，也可以选择结果并使用“编辑”菜单下的“复制”选项将比较结果复制到剪贴板以方便起见。 在其他软件中进行分析和处理。

核酸比对到此结束。 您可以看到保护程度较高的区域用相同的颜色标记。 您可以通过移动上面的红框来查看不同的区域。

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