图1. MEGA软件的下载界面

1.2 免费试用版（Free trial）

下载的地址是，https://www..com/t---.aspx。

图2.

二、软件安装完成

软件按照安装说明来进行安装，其具有一定的简易程度dnastar序列比对，事实上基本上是通过一键便可完成（此过程需要点击几下Next），软件安装成功的情况正如图3所展示的那样。

有一张图3 ，它的上一部分乃是处于 MEGA v6.06 安装完毕状态的页面 ，而下一部分则是.v7.1 安装完成之后所呈现的列表。

三、PEDV数据的准备和打开

准备好了PEDV参考毒株，这其中应当涵盖经典PEDV毒株，经典PEDV毒株来源的疫苗毒株，我国大陆地区典型的新型PEDV毒株，韩国的新型PEDV毒株以及美国的新型PEDV毒株等。对于我国流行的PEDV毒株而言，能够借助PEDV S基因来进行鉴别诊断，笔者之前也报道过，即（Chen et al., 2016）可通过S基因对的N端开展鉴别诊断，下表1是实验室刘洋师弟报道的测定PEDV S基因N端的引物。

表1. PEDV S1基因测序引物（刘洋等，2016）

那把所有的毒株，都拖进那个名为.v7.1的子软件里去打开它，然后再去点击all as one这个选项，最终以此来得到所有数据所形成的集合哦。

图4. 打开所有数据，并保存为集合

四、PEDV分子进化树的建立

以MEGA 6.06将数据集合文件打开，在其内点击Align by（图5），开展序列比对，于比对完以后，把多余序列除掉，且对毒株名称予以修改。

图5. PEDV毒株的比对

轻点Datadnastar序列比对，进行一次选择操作，接着选中位列首位之对象，对应参数的设置情况像是下图所呈现的那般。

得到了像这样的进化树，针对自己测定出来的数据去进行标记，随后点击Image去进行保存，这一部分完成了PEDV毒株分子进化树的分析。

五、PEDV毒株同源性分析（使用软件）

挑选软件，轻点File，接着Enter进行数据加载，待数据加载完毕后于View里进行选择，随后将结果另存为或者直接截取屏幕，以此获取我们所需数据。

六、总结

它讲述了PEDV测序之后的分子进化树，也阐述了同源性分析，要是存在不清晰的状况，又或者有疑惑之处，那就请于微信下方留言，多谢。

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