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DNASTAR-分子生物学研究的工作流程

发布时间:2023-08-01

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“-用于分子生物学研究、蛋白质分析、基因组学和转录组学研究的完整序列分析软件”

旨在为生命科学家提供创新且易于使用的数据分析软件工具。 无论您的重点是下一代测序组装和解剖、临床研究还是传统序列解剖,总有一个软件包可以满足您的研究需求。

如需了解完整功能请点击上图或“”

-分子生物学研究工作流程

手动虚拟克隆

每次使用 Pro,您都可以对实验室的克隆实验充满信心!

从本质上讲,分子克隆的过程非常简单,但如果没有适当的规划和考虑,即使是最简单的克隆实验也可能很快出错。 Pro 的虚拟克隆可让您轻松、自信地规划克隆实验,以便在实验室中正确进行。 Pro 提供无与伦比的灵活性,可帮助您满足实验要求,包括同时批量克隆片段组的能力,并指导您使用所有最流行的克隆方法逐步制备载体和扩增插入片段:,,,,, In- 、TA、TOPO 和 PCR 引导的限制性内切酶克隆。 Pro 中的计算机克隆为您提供正确的规划和计划,以便您每次都可以充满信心地尝试克隆!

4步执行虚拟克隆

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克隆序列验证

使用 Pro 确认您在实验室中创建的克隆的真实性

您已在实验室进行克隆并计划继续下游,但您如何知道所有步骤都产生了预期的重组克隆? 许多研究人员通过测序验证了克隆的真实性。 我们可以轻松地执行克隆序列验证,以确认您的测序结果与您设计的克隆完美匹配。 我们的克隆序列验证工作流程确认克隆完全包含正确方向的感兴趣的插入片段,与载体处于框内,并确认整个克隆中有足够的跟踪文件覆盖。 如果在克隆序列验证过程中发现差异,我们将向您准确显示差异所在,以便您解决它们。 使用 Pro 的克隆序列验证工作流程在下游实验之前捕获读取错位和插入错误。

克隆序列验证的 4 个步骤

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凝胶电泳模拟

通过 Pro 中的凝胶电泳模拟跳过试验和错误并确认您的理想条件!

凝胶电泳有时需要大量的规划工作和反复试验才能确定完美的琼脂糖比例和分子量标记集来解析 DNA 片段。 其他时候,限制性摘要形成如此复杂的限制性模式,以至于很难确定限制性摘要是否完整。 这就是我们在 Pro 中提供虚拟凝胶电泳的原因,它允许您对一个或多个 DNA 片段应用不同的限制性内切酶并模拟消化以确定电泳凝胶上产物的预期大小。 使用凝胶电泳模拟轻松确定理想的琼脂糖比例和一组分子量标记,以便在实验室进行凝胶电泳之前解析 DNA 片段。 在实验室中运行实际凝胶后,您可以将凝胶或其图像与虚拟凝胶电泳图像并排,以识别具有复杂条带图案的凝胶。 通过 Pro 中的凝胶电泳模拟跳过试验和错误并确认您的理想条件!

4步进行虚拟凝胶电泳

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多序列比对

使用 Pro 进行精确的序列比对和深入分析

众所周知,有许多多重序列比对工具,但初始序列比对只能让您到目前为止。 真正让您走上回答研究问题的道路是对齐后分析。 Pro 为您提供多序列比对每个阶段所需的一切,除了比对基因级和基因组规模序列数据所需的算法之外,还能够在比对后阶段进行更深入的挖掘。

Pro 指导您完成比对后过程,包括使用 RAxML 生成和比较多个系统发育树以获得最大残差树,或使用邻居连接方法。 您可以轻松隔离新子比对的感兴趣区域,编辑和修剪单个序列或整个比对,并在生成适合发布的高质量图像之前自定义比对的外观。

多序列比对4步

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成对序列比对

使用 Pro 轻松执行多重和成对序列比对

有时,直接从多序列比对中检测一对序列可能会让您更好地了解该对的相关性。 众所周知,有时配对序列比比较性多重比对更合适,例如,将未表征基因的序列与相关参考弧菌的基因组进行比较。 Pro 使您能够使用行业标准的史密斯算法灵活地执行局部、全局和半全局成对序列比对dnastar序列比对,所有这些都在您用于多序列比对和比对后分析的同一个应用程序中进行。 这使得通过多重比对进一步探索序列对的相关性、将转录物与基因比对或在基因组中查找基因变得容易。

成对序列比对的 4 个步骤

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PCR定点突变

在设计质粒之前了解突变的结构影响

PCR定点诱变是将突变引入DNA序列的最常见技术之一,但大多数软件工具在设计质粒时并未考虑突变对蛋白质结构的影响。 为 PCR 定点诱变的质粒设计提供了一种独特的方法,首先关注预测 DNA 序列中引入的哪些突变可能会导致蛋白质稳定性发生变化。 使用我们的热点扫描和创建变体工具,您可以快速查看哪些突变减少或增加了倍数稳定性。 一旦您确定了实验的最佳候选变体,您就可以创建 PCR 质粒,使用我们用于设计和突变质粒的点击工具将它们引入您的序列中。 与突变实验的传统试错方法相比,我们独特的连接建模和质粒设计工具组合可以为您节省时间和金钱。

PCR定点突变4步

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PCR质粒设计

使用 Pro 设计值得您第一份工作信赖的 PCR 质粒

老实说,没有什么比花费时间和金钱构建多次失败的 PCR 反应更令人沮丧的了。 虽然影响 PCR 成功的因素有很多,但通常当发生失败时,不良的 PCR 质粒设计是罪魁祸首。 Pro 通过设计 PCR 质粒来匹配您独特的实验条件,从而解决了这个问题,让您在实验室尝试之前能够听到潜在变化的影响。 Pro 实现了可指导、可编辑和可定制的完美平衡,使您还可以设计出第一次就可以信赖的 PCR 质粒。

只需 4 个步骤即可快速创建 PCR 质粒设计

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系统发育分析

准确、全面的系统发育分析软件

系统发育解剖是分子生物学的一个基本方面,也是我们理解基因、生物体和种群之间进化关系的主要工具。 Pro 提供了一个全面、易于使用的界面dnastar序列比对,用于集成多序列比对和系统发育分析,无需笨重的插件。 使用邻接或最大残差 (RAxML) 分析选项轻松构建系统发育树,生成多个树以进行并排比较,生成引导支持值等。 在作为图像导入进行发布或协作之前,自定义系统发育树的外观。

系统发育分析分 4 个步骤

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入门图

使用 Pro 轻松创建和定制精美、注释准确的底漆图!

无论您是要创建用于出版还是用于克隆实验的引物图谱,注释清晰的引物都是必不可少的。 许多引物作图工具缺乏低级选项并且使用起来很麻烦,导致图谱不可读,通常缺乏对实验至关重要的功能和限制位点。 Pro 绘图软件提供了一个优雅的界面,可以轻松创建和注释图形丰富的地图,以进行克隆、协作和发布。 轻松可视化和自定义您的引物图上的位点和特征,并使用我们广泛的、精选的特征数据库,通过我们的外部手动工具准确注释您的引物。 Pro 还包括一个自定义载体目录,为计算机克隆提供仔细注释的引物载体图谱。 告别笨拙的工具,使用 Pro 轻松创建和定制精美的底漆地图!

入门图 4 个步骤

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桑格序列组件

对装配精度充满信心

组装测序数据是 DNA 测序中最关键的步骤之一,因为准确性非常重要。 我们在序列组装软件中使用的组装算法已被证明是市场上 ABI 测序数据最准确的算法。 与竞争对手相比,我们的算法在将序列组装成单个重叠群方面做得最好,并通过迹线质量和形状调用最精确的共有序列。 组装后,Ultra 为您提供了独特的功能,可以轻松编辑组装数据(暴露或修剪末端、引入突变)以及剖析组装数据,包括查看色谱图、评估覆盖率和分析变体。 正确地做事很重要。 使用 Ultra 中的序列组装工具对组装的准确性充满信心。

桑格序列组件 4 个步骤

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序列编辑和注释

使用 Pro 在一款易于使用的应用程序中进行全面的序列编辑和注释!

序列编辑是分子生物学研究的重要组成部分,看起来任何序列编辑软件都可以做到这一点。 但最终,您选择的工具的便利性和功能性确实很重要。 除了提供序列编辑器的所有预期功能:改变核酸和肽、翻译、反向互补、添加特征、识别 ORF 以及引入限制性位点的能力外,Pro 还提供手动批量编辑工具,以便您可以编辑无缝创建和编辑序列组,让您更快地完成序列编辑目标。 Pro 中的实时交互式视图使编辑和注释序列、自定义功能以及创建引物图变得毫不费力。 我们的序列编辑软件还与 NCBI 数据库集成,用于访问和搜索在线数据库。 您使用的工具很重要。 使用 Pro 在一个易于使用的应用程序中访问序列编辑和注释所需的一切。

序列编辑和注释 4步

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