顺便对bam文件进行简单QC,参考直播我的基因组系列。为了提高比对速度,就需要根据参考基因组序列,经过BWT算法转换成index,而我们比对的序列其实是index的一个子集。当然转录组比对还要考虑到可...
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几个常用的多序列比对软件是一个简单常用的核酸序列分析软件,它支持多序列比对、序列同源性分析、限制性酶切位点分析、PCR引物设计、质粒绘图等多种功能,并且是非常友好的界面、软件占用内存小、兼容性也比较好...
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)软件不能很好的用于碱基转换的比对。尽管有一些为碱基转换测序设计的比对软件,例如,SLAM-DUNK,但是比对的结果总是很不理想。发布了一个专门为碱基转换测序设计的比对软件:HISAT-3N。支持所有...
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高级软件工程师展示了使用应用程序运行多序列比对的两种非常快速的方法。了解我们用于序列组装和分析的最新应用程序。如果使用的是单样本数据,则可以快速添加序列并运行程序集,而无需指定程序集参数。17.2中的...
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