（伪）从零开始学转录组（5） 序列比对

顺便对bam文件进行简单QC，参考直播我的基因组系列。为了提高比对速度，就需要根据参考基因组序列，经过BWT算法转换成index，而我们比对的序列其实是index的一个子集。当然转录组比对还要考虑到可...

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核酸序列分析工具

多序列比对分析软件目前有很多功能强大的生物学软件，具有丰富功能引物设计，基因序列比对，质粒图谱绘制、甚至实现了1个软件同时对DNA、RNA和蛋白质进行分析的功能。（1）是一款高度集成化的分子生物学应用...

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序列比对，科研必备的几款软件

几个常用的多序列比对软件是一个简单常用的核酸序列分析软件，它支持多序列比对、序列同源性分析、限制性酶切位点分析、PCR引物设计、质粒绘图等多种功能，并且是非常友好的界面、软件占用内存小、兼容性也比较好...

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如何进行基因组序列比对？

首先要做的就是将测序得到的reads比对到人基因组参考序列上。人基因组参考序列的来源、详细信息及下载地址已经知道啦，那么我们来看看利用什么软件或算法来将测序数据比对到31亿碱基序列上呢？大家是否对于比...

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更快更精确！专门为碱基转换测序方法设计的序列比对软件

）软件不能很好的用于碱基转换的比对。尽管有一些为碱基转换测序设计的比对软件，例如，SLAM-DUNK，但是比对的结果总是很不理想。发布了一个专门为碱基转换测序设计的比对软件：HISAT-3N。支持所有...

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dnastar序列比对 DNASTAR软件及功能介绍教程

高级软件工程师展示了使用应用程序运行多序列比对的两种非常快速的方法。了解我们用于序列组装和分析的最新应用程序。如果使用的是单样本数据，则可以快速添加序列并运行程序集，而无需指定程序集参数。17.2中的...

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用Seqman软件进行DNA序列比对的方法

”,添加需要比对的DNA序列。3、找到DNA序列所在文件夹，双击需要比对的序列，然后点击“Done”5、双击出现的比对结果，进行查看。选择.Seq格式文测序结果文件，仅可以查看序列，看不到测序峰的情况...

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