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​引物、探针、Real-time PCR 的探针设计原则。

一般定量PCR实验过程为:目的基因查找比对→探针与引物设计→探针与引物合成→配置反应体系→反应参数→重复实验,优化条件→获得曲线数据,比对标准曲线→再重复验证。引物设计原则探针设计原则探针设计

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那令人困惑的比对工具选择啊~

那时候使用的比对工具是。官方称其可以把短的DNA序列(35bp)快速的比对到人类基因组上。结论:和,是两个不同类型的比对工具,并非是的升级。/工具本身不能进行比对,它是通过调用/进行比对的。可能是因为...

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新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计,难在哪里?

在新型冠状病毒检测中,以美国CDC的第一套引物探针为例,从图1可见,上游引物处SARS病毒有一个3-bp的插入,是不可能扩增的,蝙蝠病毒在上游引物有4个突变,探针有1个突变,下游引物有5个突变,理论上...

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hisat2:比对基因组工具简介

由于测序仪机器读长的限制,在构建文库的过程中首先需要将DNA片段化,测序得到的序列只是基因组上的部分序列。为了确定测序reads在基因组上的位置,需要将reads比对回参考基因组上,这个步骤叫做。同时...

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如何进行基因组序列比对?

首先要做的就是将测序得到的reads比对到人基因组参考序列上。人基因组参考序列的来源、详细信息及下载地址已经知道啦,那么我们来看看利用什么软件或算法来将测序数据比对到31亿碱基序列上呢?大家是否对于比...

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干货:m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析

本期,我们讲讲甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验怎么做,从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信...

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