病毒序列测定及亲缘关系比对操作指南--SWINE CLUB连载-4

2、测序和序列比对可用于确定毒株种类和亲缘关系；在前一期病原学检测技术的推文中介绍过PCR检测是确定病原的利器，但是PCR出现阳性条带有可能是非特异的扩增，需要测序验证；基因测序可确诊，可排除污染；但...

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测序没收到拼接结果？不要慌，咱们自己来

最最实用的技能：测序结果的序列拼接为什么你的测序结果里没有你的引物序列？然后，我们再来讨论一下，当你拿到公司发给你的测序结果，没有拼接好的那种，该怎么办？在序列比对的过程中，测序结果含有一定的载体序列...

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比对软件STAR的使用—高通量测序数据处理学习记录（一）

在我之前的那篇RNA-seq数据分析—-方法学文章的实战练习文章里关于比对软件的比较中STAR也展现了不俗的表现。所以在处理比对时我也考虑了将与STAR共同使用，查看它们的表现情况，选取适合的比对工具...

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转录组/宏/基因组学分析流程，值得收藏

基因组学，转录组学，宏基因组学，我们想要了解分析步骤，就需要了解建库原理。从头测序，这种情况针对的是我们没有参考基因组，需要进行基因组拼接，然后进行基因预测和功能分析。其中，BWA-MEM用于将测序r...

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用Seqman软件进行DNA序列比对的方法

”,添加需要比对的DNA序列。3、找到DNA序列所在文件夹，双击需要比对的序列，然后点击“Done”5、双击出现的比对结果，进行查看。Seq格式文测序结果文件，仅可以查看序列，看不到测序峰的情况。6k...

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人工智能如何改变基因组学？

和加速计算正在为基因组测序流程开辟新的可能性。而在使用如深度学习和自然语言处理这类复杂的算法和应用对基因组进行测序后，这个数字会增加一倍以上。这在提高读取准确性的同时确保碱基检测更加实时，进一步加快了...

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病毒序列测定及亲缘关系比对操作指南--SWINE CLUB连载-4

2、测序和序列比对可用于确定毒株种类和亲缘关系；测序结果与参考毒株序列的比对能大致看出毒株的来源。

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一文搞定转录组分析方法

转录组分析方法一般而言，针对不同类型的测序数据，在进行组装序列和序列比对方法不同：有参考基因组序列的测序数据：针对有参考基因组序列的测序数据进行组装时，可以：已构建的转录组分析方法，可根据比对到基因组...

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更快更精确！专门为碱基转换测序方法设计的序列比对软件

）软件不能很好的用于碱基转换的比对。尽管有一些为碱基转换测序设计的比对软件，例如，SLAM-DUNK，但是比对的结果总是很不理想。发布了一个专门为碱基转换测序设计的比对软件：HISAT-3N。支持所有...

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干货：m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析

本期，我们讲讲甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序，结合生物信...

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