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我要移除相似性在99.99%以上的序列

不过,如果使用单独的程序进行比对,似乎又不能和参考序列的注释信息进行关联了。因此,序列注释可以基于多序列比对后并利用参考序列的基因信息。移除高度相似序列我导入比对后的核苷酸序列,运行程序分析后,拿其中...

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dnastar引物设计 寻找PCR知识的小伙伴,朝这里看过来

PCR引物设计基本原则④引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。⑤引物的5端可以修饰。在酶和引物质量好时,不出...

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SnapGene分子生物学必备软件

分子生物学必备软件用它做质粒图谱、查找酶切位点、标记基因片段属性、查看引物所在位置,查看开放阅读框所编码氨基酸、及序列比对。每次编辑序列或模拟克隆或PCR或诱变时,该程序都会自动记录在图形历史记录中。...

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dnastar序列比对 DNASTAR Lasergene Molecular Biology

综合序列分析软件,用于序列比对、桑格测序、虚拟克隆、引物设计、质粒图谱、测序编辑等。可帮助您完成重要的序列分析任务,包括多重序列比对、PCR引物设计、计算机克隆和桑格序列组装。克隆序列验证多序列比对序...

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(伪)从零开始学转录组(5) 序列比对

顺便对bam文件进行简单QC,参考直播我的基因组系列。为了提高比对速度,就需要根据参考基因组序列,经过BWT算法转换成index,而我们比对的序列其实是index的一个子集。当然转录组比对还要考虑到可...

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干货 | 一款超好用的 DNA 序列比对软件

比对软件。比对软件:查找等非常多的实用功能,下面我来详细介绍一下这几个常用的功能。再新建另一个文件,将所需序列粘贴,即可进行比对:序列翻译成蛋白序列,还可自己进行设计每行显示多长以及蛋白简写的方式。c...

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核酸序列分析工具

多序列比对分析软件目前有很多功能强大的生物学软件,具有丰富功能引物设计,基因序列比对,质粒图谱绘制、甚至实现了1个软件同时对DNA、RNA和蛋白质进行分析的功能。(1)是一款高度集成化的分子生物学应用...

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dnastar序列比对 DNASTAR V17.4.2更新

多序列比对的增强和更新包括:有许多多序列比对工具已经不是什么秘密了,但初始序列比对只能让你走这么远。Pro提供了多序列比对每个阶段所需的一切,不仅是比对基因水平和基因组规模序列数据所需的算法,而且还提...

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DNASTAR-分子生物学研究的工作流程

-用于分子生物学研究、蛋白质分析、基因组学和转录组学研究的完整序列分析软件”-分子生物学研究工作流程这使得从多个比对中进一步探索序列对的相关性、将转录本与基因比对或在基因组中找到一个基因变得容易。序列...

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转录组/宏/基因组学分析流程,值得收藏

基因组学,转录组学,宏基因组学,我们想要了解分析步骤,就需要了解建库原理。从头测序,这种情况针对的是我们没有参考基因组,需要进行基因组拼接,然后进行基因预测和功能分析。其中,BWA-MEM用于将测序r...

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dnastar序列比对 20款科研常用软件合辑(上)

是一款功能强大的参考文献管理软件。是目前整合度最高的多功能序列分析软件包,包含了一整套数据分析和管理的工具,可以进行蛋白核酸序列分析、引物设计、多序列比对、序列装配、质粒图谱查看与编辑等。功能简介:是...

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如何用DNAMAN导出序列比对图?

今天给大家介绍一下如何用软件导出序列比对图片。序列的加载与比对接下来对导入的序列进行多序列比对,方法见下图,参数全部保持默认,点“下一步”就可以。更改着色之后,就可以导出图片了。下面是导出的序列图片在...

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